Carlos Almaguer urodził się w Meksyku. Od dzieciństwa towarzyszyła mu muzyka, uczył się grać na różnych instrumentach, wtedy też rozpoczął naukę śpiewu u maestro Francisco Amodora. W wieku osiemnastu lat Carlos Almaguer zdobył trzecią nagrodę na konkursie dla młodych śpiewaków „Carlo Morelli” w Mexico City. W 1994 roku wygrał ten sam konkurs. Po przyjedzie do Barcelony uzyskał stypendium na studia w Sienie. W latach 1996-2003 uczył się u Vincenta Sardinero. W tamtym czasie zdobył wiele nagród na konkursach wokalnych na świecie, m.in.: Francisco Viñas, Jaime Aragall, Julian Gayarre, Francisca Cuart, a także na konkursach w Belgii i Portugalii. Rozwinął wszystkie techniki, z których słynie jego nauczyciel.
Carlos Almaguer występował w Niemczech, Belgii, Hiszpanii, we Włoszech, w Japonii, Meksyku, Grecji, Rumunii, Bułgarii, Australii, Szwajcarii, Austrii, Chinach, Izraelu, Chile, Stanach Zjednoczonych, Anglii, Finlandii, Holandii i Francji.
Śpiewa z sukcesami najpopularniejsze partie barytonowe (baryton dramatyczny) w operach: Andrea Chénier, Dziewczyna z Zachodu, Il Tabarro, Attila, Nabucco, Otello, Tosca, Simon Boccanegra oraz Macbeth, Rigoletto, Trubadur, Pajace, Luisa Miller, Bal maskowy, Aida i Moc przeznaczenia.
W październiku 2015 wykonywał partię tytułową w Nabucco Verdiego w Teatro Comunale di Modena i Teatro Pergolesi di Jesi. Inne znaczące role i tytuły w jego repertuarze to: Scarpia w Tosce w Marsylii i Toulon, Amonastro w Aidzie w pekińskiej NCPA i Liege, Traviata w Warszawie czy Rigoletto w madryckim Teatro Real.
Meksykański baryton występował w teatrach operowych na całym świecie, m.in. w Deutsche Oper Berlin, w operach we Frankfurcie, Lipsku i Hamburgu, na festiwalu operowym w Trapani, w Teatro Massimo w Palermo i w Arena di Verona, Opéra National du Rhin, Toulon Opera House, Stadttheater Bern, Teatro Comunale w Bolonii, Teatro Reggio w Turynie, Arena de Avenches, w Operze w Lozannie, w Carnegie Hall, Węgierskiej Operze Narodowej w Budapeszcie, Rumuńskiej Operze Narodowej w Bukareszcie, w Kanazawa Opera House, Operze Pekińskiej, Chile Opera House, w operach w Nantes, Montpellier, Marsylii, Melbourne, Atenach, Tel Awiwie, Savonlinnie, Pampelunie, Cordobie, Las Palmas i Meksyku, a ponadto w Opera de Wallonie, Gran Liceu w Barcelonie, Covent Garden (Royal Opera House) w Londynie, Concertgebouw w Amsterdamie i w Operze Wiedeńskiej.
Carlos Almaguer otrzymał medal od meksykańskich krytyków muzycznych.